Суперкомпьютер "Ломосонов" поможет в поиске лекарства от коронавируса

Среда, 8 апреля 2020 г.

Следите за нами в ВКонтакте, Facebook'e и Twitter'e

Научно-исследовательский вычислительный центр(НИВЦ) МГУ задействуют вычислительные мощности для расчётов. 8 апреля 2020 16:07

Специалисты лаборатории вычислительных систем и прикладных технологий программирования НИВЦ МГУ включились в работу по созданию лекарства от коронавируса. Для этого они задействовали суперкомпьютер «Ломоносов» под вычисления по технологиям молекулярного моделирования и докинга (метода моделирования молекул, предсказывающего наиболее выгодную для образования устойчивого комплекса ориентацию и конформацию одной молекулы в центре связывания другой и дающего оценку энергии связывания этих молекул друг с другом).

«Докинг, как и другие методы молекулярного моделирования, основан на описании взаимодействия белков-мишеней и низкомолекулярных молекул будущих лекарств, которые блокируют работу этих белков. Для многих болезней определены белки, которые отвечают за развитие патологий. Это могут быть вирусные белки, отвечающие за размножение вируса в организме или собственные белки человека, которые работают неправильно. И если мы заблокируем работу такого белка-мишени с помощью молекулы, которая избирательно свяжется с ним в его активном центре, то развитие болезни приостановится», — пояснил заведующий лабораторией вычислительных систем и прикладных технологий программирования НИВЦ МГУ Владимир Сулимов.

В настоящее время учёные уже проанализировали структуру вируса, нашли белки-мишени, на которые можно воздействовать лекарствами, а после того, как был выбран один конкретный белок, изучена его пространственная структура и комплексы с разными ингибиторами открытой базы Protein Data Bank, создали модель для докинга. Предварительный докинг молекул, закристаллизованных вместе с этим белком, позволил определить особенности активного центра этого белка и выбрать одну модель белка-мишени, которую и задействуют для следующего докинга большого количества соединений. Уже из них потом будут искать молекулы, наиболее сильно связывающихся с белком-мишенью.

Научную группу НИВЦ МГУ, результаты работы которой будут проверять экспериментально в лаборатории противовирусных и дезинфекционных средств Института вирусологии имени Д.И. Ивановского, вошли ведущий программист Алексей Сулимов, программист Данил Кутов, аспирантка кафедры медицинской физики физического факультета МГУ Анна Тащилова и аспирант факультета фундаментальной медицины МГУ Иван Ильин. Ещё больше по темам

Обсудить 0 Лучшее за неделю Читайте также

Следите за нами в ВКонтакте, Facebook'e и Twitter'e


Просмотров: 279
Рубрика: Hi-Tech
(CY)

Архив новостей / Экспорт новостей

Ещё новости по теме:

RosInvest.Com не несет ответственности за опубликованные материалы и комментарии пользователей. Возрастной цензор 16+.

Ответственность за высказанные, размещённую информацию и оценки, в рамках проекта RosInvest.Com, лежит полностью на лицах опубликовавших эти материалы. Использование материалов, допускается со ссылкой на сайт RosInvest.Com.

Skype: rosinvest.com (Русский, English, Zhōng wén).

Архивы новостей за: 2018, 2017, 2016, 2015, 2014, 2013, 2012, 2011, 2010, 2009, 2008, 2007, 2006, 2005, 2004, 2003

Сентябрь 2011: 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30
Rating@Mail.ru