Интернет очень дорогих вещей

Ульрика Рейдер, исследователь в швейцарской фармацевтической компании Philochem использует наиболее точное и чувствительное оборудование, которое только доступно. Но когда приходит время свести результаты приборов воедино ей приходится переходить от одного устройства к другому, чтобы обобщить информацию. «К каждому прибору необходимо уделять время в индивидуальном порядке, чтобы передать данные или установить удаленный доступ. Если бы все лабораторное оборудование было объединено в некую сеть, то это в значительной степени облегчило бы нашу работу.»

Но, как говорят, решение проблемы уже не за горами, подобные приложения уже создаются и испытываются и в скором времени их будет множество. По крайней мере фармацевтические компании, производители лабораторного оборудования и разнообразные сатртапы сейчас работают над этой проблемой. Сложное оборудование для исследований, такое как генные секвенаторы и биореактрры продолжают стремительно развиваться, но им все ещё не хватает возможности коммуницировать друг с другом. Во многих лабораториях ученым до сих пор приходится полагаться на скриншоты, блокноты и ручки для того чтобы передать данные из одного прибора в другой. Это крайне неэффективно и увеличивает риск возникновения ошибок. «Нам приходится многое вносить вручную», говорит Дана Вандервалл, исполнительный директор в фармацевтической компании Bristol-Myers Squibb. Исследователи должны быть способны «сосредоточится на самих исследованиях вместо того что бы бесконечно перегонять данные из одного формата в другой.»

«К каждому прибору необходимо уделять время в индивидуальном порядке, чтобы передать данные или установить удаленный доступ. Если бы все лабораторное оборудование было объединено в некую сеть, то это в значительной степени облегчило бы нашу работу.» - Ульрика Рейдер, Фармацевт и Биолог

Немецкая компания Merck KGaA, в данный момент ведет разработку программного обеспечения для автоматизации экспериментов и контроля за расходом химических веществ, которые при этом используются. В случае нехватки какого-то из химикатов исследователи смогут заказать их одним кликом. «Amazon для научного мира» - так охарактеризовал новое приложение Удит Батра, исполнительный директор Merck KGaA. В это время GlaxoSmithKline, Bristol-Myers Squibb и более десятка других компаний сотрудничают друг с другом в рамках некоммерческого проекта Allotrope Foundation, с целью выработки единого стандарта данных для лабораторного оборудования. Инициаторы проекта уверены, что такой стандарт станет настоящим лингва франка для лабораторий, точно так же как язык HTML стал, в свое время общепринятым для всех браузеров.

Оптимизация процессов

Попытки оптимизировать процесс исследований осложняются наличием на рынке большого количества компаний, производящих лабораторное оборудование. Каждый производитель использует собственное программное обеспечение, что заставляет ученых, при проведении комплексных исследований отдельно прописывать инструкции для каждого прибора по отдельности. В Allotrope же разрабатывают стандарты, которые благодаря своей независимости от конкретного оборудования позволят ученым наладить взаимодействие между различными приборами. Производители лабораторного оборудования, как правило работают с проприетарным программным обеспечением, оптимизированным под их устройства. В отличии от них компания Thermo Fisher Scientific предлагает веб платформу, которое позволяет подгружать данные и анализировать их при помощи специального набора приложений, это позволит следить за ходом исследования прямо со своего смартфона. «Наша задача состоит в том, чтобы исключить из процесса исследований неэффективный этап ручного сведения данных… Исследователи хотят сразу видеть обобщенный результат», говорит Джо Бири, глава информационного отдела в Thermo Fisher Scientific.

Тем временем лондонский стартап Synthace предлагает оптимизировать процес исследований при помощи дублирующей операционной системы для лабораторного оборудования. Они назвали ее Antha. Она позволяет исследователям определить цель исследования, задать параметры эксперимента и даже поставить процесс на паузу, когда нужно, скажем, загрузить новую платформу с жидкими образцами в прибор. Действия, предпринимаемые во время эксперимента и данные, записываются в едином формате. В Synthace уже разработали «драйверы», вроде тех которые компьютеры используют для общения с принтерами, для дюжины различных устройств, произведенных приблизительно десятком различных компаний, включая Roche и PerkinElmer.

Разработчики Antha рассчитывают, что использование их ОС станет настолько общепринятым, что в конечном итоге создатели лабораторного оборудования начнут самостоятельно создавать драйвера под него, так как это станет предоставлять их продукции конкурентные преимущества. В октябре 2015 в Synthace заявили о начале сотрудничества с компанией Merck (не путайте с Merck KGaA, это разные компании) и о ведущихся с другими крупными фармацевтическими компаниями переговорами относительно использования ими Antha в своих лабораториях. В Dow Chemical уже используют ОС от Synthace при производстве сельскохозяйственных химикатов. «Мне потребовалось более пяти лет сотрудничества с программистами для того что бы осознать насколько совершенными инструментами они на самом деле располагают», заявил Маркус Гершетер, биохимик, со-основатель и глава научного отдела Synthace. «Те трудности с которыми сейчас сталкиваются исследователи проблема не оборудования, оно замечательное, это проблема отсутствия правильного программного обеспечения.»